В 1973 г. окончил Омский Государственный медицинский институт по специальности «стоматология».
С 1987 по 1999 гг. был главным врачом городской клинической стоматологической поликлиники № 1 г. Омска.
С 1999 по 2001 гг. был заместителем директора центрального научно-исседовательского института стоматологии.
В.Д. Вагнер награжден знаком «Отличник здравоохранения», ему присвоено почетное звание Заслуженный врач Российской Федерации.
Защитил кандидатскую диссертацию на тему «Прогноз и тенденции развития стоматологии с позиции специалистов и населения».
С 2003 года В.Д. Вагнер работает в должности профессора кафедры.
В 2004 г. защитил докторскую диссертацию по теме: «Роль и место стоматологической поликлиники в механизме деятельности стоматологической службы в рыночных условиях».
С 2006 г. президент Стоматологической ассоциации России
